上海交通大学数学博士后流动站于2001年初正式建立并对外接受博士后进站工作,于2003年获得数学一级学科博士点, 2007年应用数学学科列入国家重点培育学科，自2010年数学学科排名进入全球学术ESI前1％（2014年数学学科领域共有225所大学和科研机构进入全球ESI学科排名，我国有11所，本学科排名列全国高校第3）。研究方向主要包含：代数、偏微分方程理论及其应用、常微分方程与动力系统、组合数学与图论、数论、复分析及其应用、数学物理、概率论与数理统计、应用概率统计与金融数学、科学与工程计算、运筹学与控制论、应用物理与计算神经科学等，分别属于基础数学、应用数学、计算数学、概率论与数理统计、运筹学与控制论等五个二级学科。

本学科点目前拥有专职教师及研究人员共102名，88％以上具有博士学位，其中教授30名（上海交通大学冠名讲席教授6名），中国科学院院士2名（兼职和双聘各1名）。拥有国家“千人计划”专家4名，中组部“青年千人计划”专家3名，国家国家杰出青年基金获得者4名（A类2名，B类2名），“长江学者”特聘教授2名、讲座教授2名。所有这些教师都有指导硕士研究生、博士研究生或博士后的经验。目前在研的国家自然科学基金项目57项（其中主持53项），55岁以下的教授均主持国家自然科学基金项目，2014年数学一级学科点共发表185篇SCI论文。

   本流动站已培养了一批优秀的博士后，目前已正常出站28人，在站研究人员13人。2007年来有4人主持国家自然科学基金青年基金，7人获得中国博士后专项基金，3人获得上海市博士后专项基金，他们正成为一支重要的科研骨干力量，对促进科学研究与学科建设，改善和优化师资队伍作出积极贡献。